暨南大學(xué)融媒體中心訊 近日,暨南大學(xué)中藥生物技術(shù)研究所朱建華教授和于榮敏教授團(tuán)隊(duì)在nature commnications期刊發(fā)表題目為“Dihydroartemisinic acid dehydrogenase-mediated alternative route for artemisinin biosynthesis”的研究成果。該研究首次報(bào)道了一種來(lái)自黃花蒿的二氫青蒿酸脫氫酶(Dihydroartemisinic acid dehydrogenase,AaDHAADH),AaDHAADH能夠催化AA和DHAA之間的雙向轉(zhuǎn)化。研究團(tuán)隊(duì)通過定點(diǎn)誘變技術(shù)獲得了該酶的定向優(yōu)化突變體(活性提高2.82倍),實(shí)現(xiàn)了AA到DHAA的高效轉(zhuǎn)化,并且在釀酒酵母中實(shí)現(xiàn)了DHAA的從頭合成,通過補(bǔ)料分批發(fā)酵在5 L生物反應(yīng)器中實(shí)現(xiàn)了3.97 g/L的DHAA產(chǎn)量。為ART的生物合成提供了一條更加便捷、高效的生產(chǎn)途徑。
論文封面
背景介紹:
2006年,D.K.Ro等人首次實(shí)現(xiàn)工程化酵母菌株發(fā)酵生產(chǎn)青蒿酸(Artemisinic acid,AA)——抗瘧疾藥物青蒿素(Artemisinin,ART)的前體化合物,開啟了采用合成生物學(xué)方法生產(chǎn)青蒿素類化合物(Artemisinins,ARTs)的新篇章。
2013年,C.J.Paddon等人通過對(duì)ART生物合成進(jìn)行工程化改造和定向整合,實(shí)現(xiàn)高產(chǎn)量AA的生產(chǎn)(25 g/L,5 L發(fā)酵罐)。隨后他們通過AA化學(xué)合成二氫青蒿酸(Dihydroartemisinic acid,DHAA),再經(jīng)DHAA自動(dòng)氧化實(shí)現(xiàn)半合成法生產(chǎn)ART。但化學(xué)合成和多步自動(dòng)氧化步驟仍面臨產(chǎn)量損失,成本過高等問題,導(dǎo)致目前ART的市場(chǎng)來(lái)源仍然主要依賴于直接從黃花蒿植株中提取獲得。
在ART的生物合成途徑中,AA經(jīng)DHAA轉(zhuǎn)化為ART是目前最優(yōu)的路徑(Km,ALDH1 to AO,.58 μM,Km+EDBR2 to AO+E9 μM,代謝流傾向于生成AA),而催化AA生物合成DHAA的關(guān)鍵酶一直未被發(fā)現(xiàn)(圖1)。
圖1 ART的生物合成途徑線路圖
研究?jī)?nèi)容簡(jiǎn)介:
關(guān)鍵酶的挖掘和功能驗(yàn)證:
本研究創(chuàng)新性地采用以活性導(dǎo)向的蛋白純化、蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)技術(shù)相結(jié)合的策略,成功地從復(fù)雜的植物粗酶體系中富集到目標(biāo)酶,為鑒定低豐度酶和闡明未知中間產(chǎn)物的天然產(chǎn)物生物合成途徑提供了新思路。
本研究在酶功能驗(yàn)證中不僅建立異源表達(dá)體系(大腸桿菌和本氏煙草),還將候選基因在內(nèi)源宿主(黃花蒿細(xì)胞)中進(jìn)行功能驗(yàn)證,該方法更接近酶的天然催化環(huán)境,可以真實(shí)反映其生理作用,彌補(bǔ)了異源表達(dá)系統(tǒng)的不足。同時(shí),過表達(dá)和RNAi干擾實(shí)驗(yàn)的結(jié)果相互印證,進(jìn)一步確證了AaDHAADH在催化AA/DHAA轉(zhuǎn)化和ART生物合成中的關(guān)鍵作用(圖2)。
圖2 轉(zhuǎn)基因黃花蒿細(xì)胞系中AaDHAADH的相對(duì)表達(dá)情況及化合物AA、DHAA和ART的含量變化。
在釀酒酵母中從頭合成DHAA:
為了實(shí)現(xiàn)DHAA的發(fā)酵生產(chǎn),作者通過對(duì)MVA途徑(ERG10、ERG19、IDI1、tHMG1和ERG20)和ART下游生物合成途徑中的關(guān)鍵基因(ADS、CYP71AV1、CPR、ALDH1、ADH1、CYB5和AaDHAADH(P26L))進(jìn)行定向整合,得到高產(chǎn)DHAA的釀酒酵母底盤菌株(菌株DHAA-2)。菌株DHAA-2在250 mL搖瓶中的發(fā)酵產(chǎn)量為0.35 g/L,采用5 L生物反應(yīng)器對(duì)菌株DHAA-2進(jìn)行分批補(bǔ)料發(fā)酵,在216 h時(shí)DHAA的產(chǎn)量達(dá)到3.97 g/L(圖3)。AaDHAADH的發(fā)現(xiàn),為半合成法生產(chǎn)ART提供了一條更加經(jīng)濟(jì)、高效的DHAA來(lái)源途徑。
圖3 釀酒酵母中DHAA的代謝工程
A:ART生物合成途徑關(guān)鍵基因的整合;B:搖瓶發(fā)酵中AA與DHAA的產(chǎn)量(a:tHMG1+ERG10+ERG19+IDI1+ERG20+ADS+CYP71AV1;b:CPR+ALDH1;c:CYB5+ADH1;d:AaDHAADH(P26L);e:PTHI2);C:菌株DHAA-2與AA-3的搖瓶發(fā)酵與5 L生物反應(yīng)器發(fā)酵的產(chǎn)量;D:菌株DHAA-2在5 L生物反應(yīng)器中的生長(zhǎng)及產(chǎn)量。
在本氏煙草中重構(gòu)ART的生物合成途徑:
基于DHAA可以自動(dòng)氧化生成ART的特性,作者通過瞬時(shí)表達(dá)ART生物合成途徑中的關(guān)鍵基因(tHMG1、ERG20、ADS、CYP71AV1、CPR、CYB5、ADH1、ALDH1和AaDHAADH(P26L)),在本氏煙草中重構(gòu)ART的生物合成途徑(圖4-A)。通過在本氏煙草中共表達(dá)ADS、CYP71AV1和CPR,發(fā)現(xiàn)AA的產(chǎn)量為0.28 mg/g DW(圖4-B,D)。當(dāng)引入ADH1、ALDH1和CYB5后,AA產(chǎn)量提升至0.62 mg/g DW(圖4-B,D)。進(jìn)一步通過添加MVA途徑的關(guān)鍵基因tHMG1和ERG20優(yōu)化瞬時(shí)表達(dá)系統(tǒng),成功將AA產(chǎn)量提高至1.19 mg/g DW(圖4-B,D)。加入定向優(yōu)化的活性酶AaDHAADH(P26L)后,DHAA產(chǎn)量達(dá)到0.51 mg/g DW(圖4-C,D),但在瞬時(shí)表達(dá)的本氏煙草中未檢測(cè)到ART。為加速DHAA自動(dòng)氧化生成ART,作者對(duì)本氏煙草葉片進(jìn)行紫外線照射處理,最終檢測(cè)到ART產(chǎn)量為0.041 mg/g DW(圖4-C,D)。
利用本氏煙草瞬時(shí)表達(dá)系統(tǒng)重構(gòu)AA/DHAA/ART生物合成途徑,不僅證實(shí)了 AaDHAADH在異源植物體內(nèi)的催化功能,也為后續(xù)工程化植物合成ART積累了重要的元件和思路,對(duì)探索ART轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制、提高植物合成效率具有重要意義。同時(shí),這一研究也揭示了DHAA經(jīng)自動(dòng)氧化生成ART的化學(xué)轉(zhuǎn)化機(jī)制,進(jìn)一步佐證了DHAA是ART生物合成的直接前體。
圖4 在本氏煙草中重構(gòu)ART的生物合成途徑
A:在本氏煙草中ART的生物合成線路圖;B:在本氏煙草中瞬時(shí)表達(dá)關(guān)鍵酶生產(chǎn)AA的LC-MS檢測(cè)(m/z=233.2);C:在本氏煙草中瞬時(shí)表達(dá)關(guān)鍵酶生產(chǎn)DHAA(m/z=235.2)和ART(m/z=283.1)的LC-MS檢測(cè);D:不同基因組合侵染處理的煙草葉片中產(chǎn)物AA、DHAA和ART的含量。
結(jié)論:
本研究在ART生物合成中成功鑒定獲得活性酶AaDHAADH,填補(bǔ)了AA生物合成DHAA關(guān)鍵酶的空白。同時(shí),本研究在釀酒酵母中實(shí)現(xiàn)了DHAA的從頭合成,在5 L生物反應(yīng)器中的產(chǎn)量達(dá)到3.97 g/L,展現(xiàn)了良好的應(yīng)用前景。此外,本研究在本氏煙草中重構(gòu)了ART的生物合成途徑,進(jìn)一步驗(yàn)證了AaDHAADH在植物體內(nèi)的催化功能,也為ART的工程化植物合成提供了新的元件和思路。
論文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41467-025-59312-1
責(zé)編:周會(huì)謙